בשער זה נבאר את סדר עמידת הספירות, כלומר כיצד הן מסודרות ומאורגנות זו ביחס לזו, כי ידיעת הסדר היא יסוד להבנת ההנהגה האלוקית. וכבר רמזנו בשער הראשון שהספירות מסודרות בשלושה קווים: ימין, שמאל ואמצע. אך יש בעניין זה פרטים רבים שצריכים ביאור מעמיק.
הסדר הראשון הוא סדר "עיגולים ויושר". יש מן המקובלים שאמרו כי הספירות מסודרות כעיגולים זה בתוך זה, כקליפות הבצל, שהעיגול החיצון ביותר הוא הכתר והפנימי ביותר הוא המלכות. ויש שאמרו שהן מסודרות ביושר, כלומר בקו ישר מלמעלה למטה, כסולם שהכתר בראשו והמלכות בתחתיתו. והאמת היא ששני הסדרים קיימים: בתחילת האצילות היו הספירות בסדר עיגולים, ואחר כך נסדרו גם ביושר.
ועניין שלושת הקווים הוא כך: קו ימין — חכמה, חסד, נצח — מורה על מידת ההשפעה והנתינה, כי הימין פתוח לתת ולחון. קו שמאל — בינה, גבורה, הוד — מורה על מידת הצמצום וההגבלה, כי השמאל דוחה ומגביל. וקו האמצע — כתר, תפארת (דעת), יסוד, מלכות — מורה על מידת האיזון וההכרעה, כי האמצע מכריע בין ימין ושמאל ומביא לשלמות.
ודע כי סדר הספירות בפרצוף אדם קדמון הוא כך: הכתר בראש, החכמה במוח הימני, הבינה במוח השמאלי, החסד בזרוע הימנית, הגבורה בזרוע השמאלית, התפארת בגוף, הנצח ברגל הימנית, ההוד ברגל השמאלית, היסוד בברית, והמלכות ברגליים. ומכאן נלמד שהאדם נברא בצלם אלוקים ממש, כי מבנה גופו מכוון כנגד מבנה הספירות.
ויש סדר נוסף הנקרא "פרצופים": הספירות מתחברות ויוצרות חמישה פרצופים — עתיק יומין, אריך אנפין, אבא, אמא, וזעיר אנפין עם נוקביה. כל פרצוף הוא מערכת שלמה של עשר ספירות, ויש ביניהם יחסי השפעה וקבלה. סדר הפרצופים הוא עניין עמוק שהרחיב בו האר"י הקדוש, אך יסודותיו כבר נרמזו בזוהר הקדוש.
ודע כי סדר עמידת הספירות אינו קבוע ומוחלט, אלא משתנה לפי העניין. בעת ההשפעה — הספירות מסודרות מלמעלה למטה; בעת התפילה — מלמטה למעלה; בעת התיקון — משמאל לימין; בעת הדין — מימין לשמאל. וכל סדר מגלה פן אחר של ההנהגה האלוקית.
ונחלקו המקובלים הראשונים בשאלה: האם הדעת נחשבת כספירה או לא. יש אומרים שהדעת היא ספירה ממש העומדת במקום הכתר כשהכתר מסתלק, ויש אומרים שאינה ספירה אלא בחינה פנימית של הכתר. ואנו מיישבים ואומרים שהדעת היא בחינת הפנימיות של הכתר, והיא מתגלית כספירה בפני עצמה כשצריך לגלות את הנסתר.
ונמצא שסדר עמידת הספירות הוא סוד מבנה המציאות כולה, כי כל מה שנמצא בעולם בנוי על פי הסדר הזה — ימין ושמאל ואמצע, עליון ותחתון, פנים ואחור. ומי שמבין את סדר הספירות מבין את סדר הבריאה ואת מפתח ההנהגה האלוקית.