בשער זה נבאר את סוד הנשמה ומדרגותיה, כי הנשמה היא חלק אלוק ממעל ממש, והיא הנקודה האלוקית שנטע הבורא יתברך בתוך האדם. וידוע כי חמש מדרגות יש בנשמה, וכולן רמוזות בכתוב: נפש, רוח, נשמה, חיה, יחידה. ואף על פי שבלשון בני אדם קוראים לכולן בשם "נשמה", הרי שכל מדרגה היא עולם בפני עצמו.
הנפש — היא המדרגה התחתונה ביותר, והיא מתלבשת בגוף ומחיה אותו. היא כנגד ספירת המלכות ועולם העשייה, ובה נמצאים כוחות החיים הטבעיים — התנועה, ההרגשה, הדמיון והחשק. והרוח — היא מדרגה גבוהה יותר, כנגד ספירת התפארת ועולם היצירה, ובה נמצאים כוחות הרגש והמידות — האהבה, היראה, השמחה והתפארת.
והנשמה עצמה — היא מדרגה עליונה יותר, כנגד ספירת הבינה ועולם הבריאה, ובה נמצא כוח השכל וההבנה. והחיה — גבוהה עוד יותר, כנגד ספירת החכמה ועולם האצילות, ובה נמצאת חכמת הנשמה הנובעת מלמעלה. והיחידה — היא המדרגה העליונה ביותר, כנגד ספירת הכתר, והיא הנקודה הפנימית ביותר של הנשמה שדבוקה ממש באור האין סוף.
ודע כי לא כל אדם זוכה לגילוי כל חמש המדרגות. רוב בני האדם חיים עם מדרגת הנפש בלבד, ועל ידי עבודה ולימוד תורה יזכו לגילוי הרוח, ועל ידי עבודה גדולה יותר יזכו לגילוי הנשמה, וכן הלאה. ויש צדיקים גדולים שזכו לגילוי החיה ואף היחידה, והם יחידי סגולה שבכל דור.
והנשמות כולן שורשן באילן הספירות, וכל נשמה ונשמה יש לה שורש מיוחד בספירה מסוימת. יש נשמות ששורשן בחסד ועל כן טבעם נוטה לחסד ואהבה, ויש ששורשן בגבורה ועל כן טבעם נוטה ליראה ודין, ויש ששורשן בתפארת ועל כן טבעם מאוזן ושלם. ושורש הנשמה הוא המגדיר את אופי האדם ואת דרכו בעבודת ה'.
ויש קשר עמוק בין הנשמה למצוות, כי כל נשמה באה לעולם עם תפקיד מיוחד — תיקון מסוים שעליה לתקן, וכנגד אותו תיקון יש מצוות מיוחדות שהיא צריכה לקיים בשלמות יתירה. ועל כן מצינו שיש אנשים שמצוה מסוימת קלה להם ואחרת קשה, כי הדבר תלוי בשורש נשמתם ובתיקון שלהם.
ודע כי הנשמה אינה נכנסת כולה בגוף, אלא חלקה למעלה וחלקה למטה. החלק שבגוף הוא הנפש והרוח, והחלק שלמעלה הוא הנשמה, החיה והיחידה. ואף על פי שהחלק העליון נמצא למעלה, הרי הוא מחובר לחלק התחתון, וכשהאדם מתעלה בעבודתו הוא מושך אליו את החלקים העליונים יותר ומגלה בתוכו מדרגות חדשות של קדושה.
ונמצא שכל עבודת האדם בעולם הזה היא להעלות את נשמתו ולגלות את כל מדרגותיה, מן הנפש עד היחידה, ועל ידי כך מחבר את התחתונים בעליונים ומשלים את כוונת הבריאה, שהיא להביא את האור האלוקי לתוך העולם ולגלות את כבוד ה' בכל המציאות.