דע, כי אחר שתיקן האדם את הנפש ואת הרוח, זוכה לבחינת הנשמה, שהיא מדרגה עליונה מאוד השייכת לעולם הבריאה. הנשמה היא מקור השכל העליון והדעת האלוקית, ותיקונה הוא על ידי לימוד התורה בעמקות ובהשגת סודות האלוקות.
וביאר מורי האר״י ז״ל, כי תיקון הנשמה נעשה בעיקר על ידי עיון בתורה ובפרט בתורת הנסתר, כי הנשמה שייכת לעולם הבריאה שהוא עולם ההשגה והבינה. וכאשר האדם עוסק בתורה לשמה ומעמיק בסודותיה, הוא מתקן ומשלים את בחינת הנשמה שלו.
ודע, כי הנשמה היא בחינת "אימא עילאה" — הבינה, וכשם שהאם מולידה ומגדלת את בניה, כך הנשמה מולידה בתוך האדם את ההשגות וההבנות הרוחניות. ולכן נקראת "נשמה" מלשון "נשימה", כי היא חיות רוחנית עליונה הנושמת באדם את אור האלוקות.
ואמר מורי ז״ל, כי מי שזכה לבחינת הנשמה, יכול להשיג דברים נסתרים ולהבין סודות התורה שאין אחרים מסוגלים להבין. כי הנשמה היא כלי להשגת האור האלוקי, וככל שהנשמה מתוקנת יותר, כך ההשגה גדולה יותר.
וצריך להבין, כי תיקון הנשמה אינו דבר פשוט, ולא כל אדם זוכה לו. שהרי רבים הם המתקנים את נפשם ואת רוחם, אך מעטים הם המגיעים לתיקון הנשמה. ולכן רוב הגלגולים הם לצורך תיקון הנפש והרוח, ומיעוט הגלגולים הם לצורך תיקון הנשמה.
ודע עוד, כי כאשר הנשמה מתוקנת, היא מאירה באור גדול ומשפיעה על הרוח והנפש שלמטה ממנה. כי האור יורד מלמעלה למטה, ונשמה מתוקנת מזככת את הרוח, ורוח מזוככת מטהרת את הנפש. ולכן אמרו חז״ל שתלמיד חכם אמיתי — שתיקן את נשמתו — משפיע קדושה על כל סביבתו.
וביאר מורי ז״ל, כי הנשמה קשורה לשלוש ספירות עליונות: כתר, חכמה ובינה. ותיקון כל אחת מהן הוא עבודה רוחנית עמוקה: תיקון הבינה הוא על ידי לימוד התורה בהעמקה. תיקון החכמה הוא על ידי השגת הארת הסודות. ותיקון הכתר הוא על ידי ביטול מוחלט לרצון ה׳, שהיא המדרגה הגבוהה ביותר.
והנה, כאשר אדם משלים את תיקון הנשמה, הוא זוכה למדרגת צדיק גמור, ונשמתו מאירה באור עצום המתפשט בכל העולמות. ועל כגון דא אמר הכתוב "נר ה׳ נשמת אדם" — שנשמתו של האדם היא כנר המאיר באור אלוקי.
וזהו שאמרו חז״ל "עתידים צדיקים שתשרה שכינה ביניהם" — שמי שהשלים את תיקון הנפש, הרוח והנשמה, זוכה שהשכינה שורה עליו ממש. וזוהי התכלית העליונה של הגלגול — שתגיע הנשמה לשלמותה ותדבק באור האין סוף ברוך הוא.